在中国，个人所得税的计算采用累计预扣法，具体到工资收入超过5000元（实际上，目前中国的个税起征点为每月5000元）的情况，以下是一般性的计算方法和步骤。请注意，实际操作中可能会根据最新的税收政策有所调整。

一、基本扣除

首先，从工资中扣除5000元作为基本免税额。

二、专项附加扣除

如果符合特定条件，还可以享受专项附加扣除，如子女教育、继续教育、大病医疗等，这些扣除可以进一步减少应纳税所得额。

三、税率表

超过5000元部分将按照超额累进税率表来计算应缴纳的税款。中国现行的个人所得税税率表如下：

- 不超过3,000元的部分，适用3%的税率；

- 超过3,000元至12,000元的部分，适用10%的税率；

- 超过12,000元至25,000元的部分，适用20%的税率；

- 超过25,000元至35,000元的部分，适用25%的税率；

- 超过35,000元至55,000元的部分，适用30%的税率；

- 超过55,000元至80,000元的部分，适用35%的税率；

- 超过80,000元的部分，适用45%的税率。

四、计算过程示例

假设某员工月收入为10,000元，无其他专项附加扣除，则其应纳税所得额为5,000元（即10,000 - 5,000）。

根据上述税率表：

- 前3,000元按3%税率计算，即3,000 3% = 90元；

- 剩余2,000元按10%税率计算，即2,000 10% = 200元。

因此，该员工当月需缴纳的个人所得税总额为90 + 200 = 290元。

五、注意事项

- 实际计算时，请根据最新的个税政策和个人具体情况调整。

- 专项附加扣除项目可能因地区和个人情况有所不同。

- 对于复杂的财务状况或不确定如何申报，建议咨询专业的税务顾问。

以上内容仅供参考，具体操作请遵循当地税务局的规定。