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增强表观遗传时钟的可靠性

茅纯纪
导读 表观遗传时钟是基于 DNA 甲基化的强大生物标志物,用于追踪人口研究、临床试验和个人健康应用中的衰老。旨在测量生物学年龄,它们强烈预

表观遗传时钟是基于 DNA 甲基化的强大生物标志物,用于追踪人口研究、临床试验和个人健康应用中的衰老。旨在测量生物学年龄,它们强烈预测与年龄相关的发病率和率以及健康的其他方面。现在,耶鲁大学医学院的科学家与国际研究同事合作,开发了一种新方法,使它们更加可靠。

根据发表在《自然衰老》杂志上的这项研究,当从同一个血液样本中估计出两个或多个测量值(称为技术复制)时,使用先前开发的时钟估计一个人的表观遗传年龄通常可能相差 9 年。这种噪音限制了表观遗传时钟的效用,特别是对于跟踪这些测量随时间变化的纵向研究。

然而,以前在耶鲁大学医学院的 Morgan Levine 博士实验室的一种新方法能够几乎完全减少这种差异。Albert Higgins-Chen 医学博士、精神病学助理教授和该论文的第一作者表示,新的计算方法可用于从旨在预测衰老和率的生化测试中分离和消除“技术噪音”。

“表观遗传时钟的重测可靠性受到的关注相对较少,”Higgins-Chen 说。“我们发现了表观遗传时钟,在一次测试中可以说你在生物学上是 50 岁,然后在下一次测试中是 59 岁。我们从现有的常用时钟开始,发现了一个单一的变化——增加了一种称为主成分分析的技术——可以保留老化信号,同时显着降低噪音。现在,对于大多数测试,同时进行的两次测量将相差不到一年。这也意味着一个人的纵向时钟变化更有可能反映真正的生物老化而不是技术噪音。”

这些发现对从流行病学研究到临床试验的应用具有重要意义。这些新开发的表观遗传时钟预测疾病和衰老的结果与传统时钟相似,但在纵向跟踪时它们也显示出更稳定的轨迹。该团队进一步证明,当使用表观遗传时钟作为临床终点时,使用新的表观遗传时钟版本可以大大减少干预测试和临床试验中的样本量需求。

Morgan Levine 博士——在她最近搬到 Altos 实验室之前曾领导耶鲁大学病理学系生命系统衰老实验室——警告说,“虽然表观遗传时钟作为衰老的生物标志物显示出很多希望,但我们需要如果我们想有一天用它们来测试对衰老和疾病的干预措施,就继续努力使这些措施更加可靠和有效。”